MQX RTOS に複数の脆弱性が確認された。影響を受けるのはバージョンによって異なり、MQX version 5.0 の RTCS DHCPにはバッファオーバーフロー、MQX RTOS version 4.1とそれ以前のバージョンには境界外読み取りの脆弱性が存在する。これらの脆弱性が悪用されると、攻撃者に細工された DHCPまたはDNSパケットの送信によりバッファオーバーフローやメモリ破損により任意のコードが実行される恐れがある。解決策として、 CVE-2017-12718の脆弱性はパッチMQX version 5.0、CVE-2017-12722 はversion 4.2 以降のバージョンにアップデートするよう推奨している。